Als ihr die geheime Organisation »Akai Umi« (Rotes Meer) gegen ihren Willen die DNA von Musashi, einem legendären Schwertkämpfer, einimpft, wird Hagane Yakushimaru zu einer Meisterfechterin mit übernatürlichen Kräften. Sie zieht los, um ihre Eltern zu retten, die von der Akai Umi entführt wurden und trifft dabei auf andere Leute, die ebenfalls mit der DNA von historischen Figuren geimpft wurden. Aber was ist Haganes Geheimnis? Warum ist sie die einzige weibliche DNA-Empfängerin? Was genau ist das Projekt mit den Namen »Offenbarungen des neuen Millenniums«?